一、办理专利转让合同备案的部门
专利实施许可合同双方涉及外国人、外国企业或组织的，当事人必须到国家知识产权局备案。专利实施许可合同双方皆为国内个人、企业或组织的，当事人可到国家知识产权局专利局在全国设立的代办处办理。
二、五证不全的房子合同受法律保护吗
根据《民法典》规定，开发商五证不全的，合同有没有效要依据具体情况而定。如果是真实意思表示，不违反法律强制性规定和公序良俗的，具有法律效力。
《中华人民共和国民法典》
第一百四十三条 【民事法律行为有效的条件】具备下列条件的民事法律行为有效：
（一）行为人具有相应的民事行为能力;
（二）意思表示真实;
（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
三、专利转让合同备案要什么手续
专利实施许可合同备案是指专利行政管理部门或者受其委托的部门对当事人已经缔结并生效的专利实施许可合同加以留存，并对外公示的行为。
根据专利法实施细则和国家知识产权第十八号局长令《专利实施许可合同备案管理办法》的规定：专利实施许可合同签订后，当事人（许可方和被许可方）应当在合同生效之日起3个月内到国家知识产权局指定的部门办理备案手续。许可方和被许可方应当共同委托一个具有完全民事行为能力的自然人办理备案手续。
专利备案多少钱，目前暂无明确规定，一般是50元-100元不等。
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引用法条：
[1]《中华人民共和国民法典》第一百四十三条
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