补充协议是对原合同的补充或者变更，一般要明确约定，如果补充协议条款与原合同不一致或发生冲突时，应当以补充协议为准。
签订合同之后，发现内容还需补充的，可以拟定合同补充协议。合同补充协议的拟定需要注意几个信息：
一是双方当事人的基本信息需全面具体；
二是说明拟定补充协议的原因；
三是协议补充的内容或变更的内容。
当补充合同的约定与主合同的约定发生矛盾时，应该以时间在后的约定条款为准执行。所以，补充合同的效力优于主合同的效力。时间在后的约定，实际上是对主合同的原约定的重新修订，该新约定是补充合同的精要和实质。如果仍以主合同的原条款为准执行，那就失去了补充合同存在的意义。
二、补充协议怎么写才有效
补充协议的成立生效与主合同成立生效的依据相同，补充协议有效须具备形式要件和实质要件。
实质要件包括三个方面：
①主体合格。即当事人应具备相应的民事行为能力。
②当事人意思表示真实。
③不违反法律行政法规强制性规定，不损害社会公共利益，不违背公序良俗。
形式要件包括两个方面：
①法律、行政法规规定采用书面形式的，应当采用书面形式；
②当事人约定采用书面形式的，应当采用书面形式。
相关法律规定：
《中华人民共和国合同法》第六十一条
合同生效后，当事人就质量、价款或者报酬、履行地点等内容没有约定或者约定不明确的，可以协议补充；不能达成补充协议的，按照合同有关条款或者交易习惯确定。
第七十七条 当事人协商一致，可以变更合同。
法律、行政法规规定变更合同应当办理批准、登记等手续的，依照其规定。
第七十八条 当事人对合同变更的内容约定不明确的，推定为未变更。
以上就是关于“补充协议与原合同冲突怎么办”的解答。补充合同是对正式合同的一种补充和修改。如果正式合同与补充合同在某些地方条款不一致，以补充合同为准。补充合同同正式合同一样具有法律效力。以上就是本文全部内容，如果您还有想要了解的问题，欢迎在线咨询法律网专业律师，他们将为您解答疑问。
引用法条：
[1]《中华人民共和国合同法》第六十一条
[2]《中华人民共和国合同法》第七十七条
[3]《中华人民共和国合同法》第七十八条
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