一、借款协议中约定的违约金是否合法有效
借款协议中约定的违约金是合法有效，民事活动中法律没有禁止性规定的都属于合法行为。当事人可以在合同中约定一方违约时根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。
法律网提醒您，《中华人民共和国民法典》第五百八十五条，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。 约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。
二、违约金有什么种类
违约金一共有以下两种：
1.惩罚性违约金，其作用全在惩罚，如果对方因违约而遭受财产损失，则违约一方除支付违约金外，还应另行赔偿对方的损失。
2.补偿性违约金，是对合同一方当事人因他方违约可能遭受的财产损失的一种预先估计，给付了违约金，即免除了违约一方赔偿对方所遭受的财产损失的责任；即使损失大于违约金，亦不再补偿。
三、滞纳金和违约金的区别
1.违约金和滞纳金分属两个不同的概念，滞纳金属于行政法律中的概念，是因行政管理相对人违反法律规定的缴费义务，比如缴税。违约金是因违反合同约定、向对方支付的具有赔偿性的金钱给付义务，而借款合同中即可以约定违约金；
2.违约金和滞纳金的强制性不同，滞纳金具有法律强制性，而违约金不具备；发生一方违约后、守约方要求违约方承担违约责任时，如果约定的违约金“低于”实际发生的损失，守约方可以起诉到法院请求增加违约金如果约定的违约金“过分”高于实际损失，违约方可以起诉到法院请求减少违约金；
3.违约金和滞纳金发生的主体不一致，滞纳金发生在不平等的行政关系主体之间，比如民警跟公民，反之，违约金发生在平等民事主体之间。
引用法条：
[1]《中华人民共和国民法典》第五百八十五条
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